RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 ACAP1Q15027 740 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 BSNDQ8WZ55 320 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 AP2M1Q96CW1 435 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 OLFM1Q99784 485 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 AP3D1O14617 1153 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CLCNKBP51801 687 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LBX1P52954 281 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCL14Q16627 93 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LGMNQ99538 433 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 APOC2P02655 101 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CXCR3P49682 368 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PRKG2Q13237 762 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 UGCGQ16739 394 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 EID3Q8N140 333 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LCN9Q8WX39 176 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RNF145Q96MT1 663 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ETS1P14921 441 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PPP3CAQ08209 521 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 VSTM1Q6UX27 236 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 KCNK18Q7Z418 384 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ULK1O75385 1050 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATP4AP20648 1035 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PDX1P52945 283 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 DLK2Q6UY11 383 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 AHI1Q8N157 1196 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A0A0MRY4 1105 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 NRIP1P48552 1158 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CHSY3Q70JA7 882 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPATA13Q96N96 652 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RIPK3Q9Y572 518 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM187BQ17R55 369 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 NMUR1Q9HB89 426 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 CROTQ9UKG9 612 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MYL12BO14950 172 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PEX11AO75192 247 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ERCC2P18074 760 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 NT5EP21589 574 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 KCNA3P22001 575 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RPIAP49247 311 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 COX10Q12887 443 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 MEIS2O14770 477 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 PSMB9P28065 219 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 INAQ16352 499 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 RBFAQ8N0V3 343 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC8-201ENST00000283351 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRATO95237 230 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 GIMD1P0DJR0 217 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITGB5P18084 799 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 TSPAN8P19075 237 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 ITPKAP23677 461 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTPN9P43378 593 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC5A3P53794 718 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 CAMK1Q14012 370 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 DPYSL3Q14195 570 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC8-201ENST00000283351 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms