RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 CblP22682 913 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casp2P29594 452 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc22a16Q497L8 649 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krba1Q6NXZ1 1043 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp398Q8BV16 643 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr371Q8VGB8 312 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sytl1Q99N80 567 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufab1Q9CR21 156 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 MrgbpQ9DAT2 204 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem115Q9WUH1 350 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il13ra1O09030 424 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spp1P10923 294 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ephx3Q3V1F8 367 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf215Q5SPX3 379 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cxcl17Q5UW37 119 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nab1Q61122 486 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl2l1Q64373 233 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr667Q7TRP4 326 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr12Q80TA6 747 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc27Q80YS5 523 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elp6Q8BK75 266 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cwf19l1Q8CI33 537 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trip10Q8CJ53 603 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gfm2Q8R2Q4 779 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acsf2Q8VCW8 615 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem80Q9D3H0 123 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp4a14O35728 507 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc127Q3TC33 260 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl17Q3U2U7 461 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmf1Q3U3R4 574 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tead4Q62296 427 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rccd1Q8BTU7 377 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camk1dQ8BW96 385 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr61Q8C010 449 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smyd2Q8R5A0 433 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdyl2Q9D5D8 503 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh1P09803 884 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 RhoP15409 348 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 F3P20352 294 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adra1dP97714 562 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd300lgQ1ERP8 331 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 CamkmtQ3U2J5 323 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Garnl3Q3V0G7 1038 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdpd5Q640M6 607 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam72aQ8BFZ8 149 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 CptpQ8BS40 216 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 TbcdQ8BYA0 1196 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps39Q8R5L3 886 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr478Q8VG04 314 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emid1Q91VF5 444 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Retreg3Q9CQV4 466 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 IkbipQ9DBZ1 373 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il1rl2Q9ERS7 574 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2afb2S4R1M3 115 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A286YCD0 109 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Man1b1A2AJ15 658 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam46dB1ATX6 390 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Diaph2O70566 1098 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap1g2O88512 791 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcpt4P21812 246 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Man1a1P45700 655 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thumpd3P97770 505 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmb4P99026 264 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Heatr9Q5QNV8 569 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amer3Q6NS69 780 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpp38Q80UU2 280 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc43a1Q8BSM7 564 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hectd2Q8CDU6 774 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mill2Q8HWE5 355 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slco3a1Q8R3L5 710 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 GzmnQ920S1 248 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Agpat3Q9D517 376 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PllpQ9DCU2 182 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdelc1Q9JHP7 502 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 EefsecQ9JHW4 583 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 NagaQ9QWR8 415 aa11.86□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ebf3O08791 596 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cxcr3O88410 367 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc2a7P0C6A1 513 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctps1P70698 591 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pih1d3Q3KNI6 218 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt18Q3U2V3 323 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap44Q5SSM3 814 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ripor1Q68FE6 1223 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap25Q8BYW1 648 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r214Q8R279 367 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc42Q8R2U7 421 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bag2Q91YN9 210 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stard13Q923Q2 1113 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 AdprmQ99KS6 340 aa11.85□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.6 ms