RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nsmce4aG3XA30 381 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r168K7N6B6 309 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Limk2O54785 638 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Socs5O54928 536 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ctbp1O88712 441 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajb5O89114 348 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cxcr2P35343 359 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgm3Q08189 693 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B3gnt4Q1RLK6 350 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adora2aQ60613 410 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tfdp2Q64163 446 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmc6Q7TN60 810 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr594Q7TRR4 311 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb41Q811F1 908 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Insig1Q8BGI3 259 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl21cQ8BLU2 248 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pak4Q8BTW9 593 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Med19Q8C1S0 244 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam110bQ8C739 366 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tldc1Q8K0P3 455 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OafQ8QZR4 282 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb18Q8VHA6 467 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam83dQ9D7I8 585 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb4Q9WV71 426 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plxna2P70207 1894 aa22.91■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3604A0A087WPN2 559 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Catsperg2C6KI89 1145 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atf6F6VAN0 656 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc191J3QQ27 883 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psma3O70435 255 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sod2P09671 222 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hsd17b2P51658 381 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q3TYS2 187 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B3gntl1Q3U129 357 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dtd2Q8BHA3 168 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FicdQ8BIX9 458 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap36Q8C6E0 343 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm42417Q8K1D0 126 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa22.9■■□□□ 1.26
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BC034090A0A087WP46 1202 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pex5O09012 639 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bhlhe40O35185 411 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MdkP12025 140 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 F3P20352 294 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Timp2P25785 220 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChatQ03059 641 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Garem1Q3UFT3 876 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pon2Q62086 354 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oxsr1Q6P9R2 527 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r43Q80Z08 845 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tarsl2Q8BLY2 790 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dennd1aQ8K382 1016 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx22Q8K402 517 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr665Q8VG79 316 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SharpinQ91WA6 380 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Laptm4bQ91XQ6 227 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lpin1Q91ZP3 924 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Edem1Q925U4 652 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rec114Q9CWH4 259 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dus2Q9D7B1 493 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ItpaQ9D892 198 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf654Q9DAU9 571 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anxa9Q9JHQ0 345 aa22.89■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zc3h12bG3X9I7 835 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RngttO55236 597 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnt1P04426 370 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd44P15379 778 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TigitP86176 249 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt86P97861 486 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trip13Q3UA06 432 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tsr1Q5SWD9 803 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr366Q7TRY4 309 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B3galnt2Q8BG28 504 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc87Q8CDL9 855 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdac8Q8VH37 377 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GcshQ91WK5 170 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Themis2Q91YX0 663 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrp8Q924X6 996 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ska2Q9CR46 120 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sp2Q9D2H6 612 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpv4Q9EPK8 871 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rad1Q9QWZ1 280 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CorinQ9Z319 1113 aa22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrebbpP45481 2441 aa22.87■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cxcr3O88410 367 aa22.87■■□□□ 1.25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxb3P09026 433 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.7 ms