RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	DSC2	Q02487	901 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RCN3	Q96D15	328 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	OLFM1	Q99784	485 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GMIP	Q9P107	970 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT4	O43236	478 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	THRA	P10827	490 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KCNA5	P22460	613 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PKNOX1	P55347	436 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ELN	P15502	786 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PEX2	P28328	305 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CRABP2	P29373	138 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MTTP	P55157	894 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TBX4	P57082	545 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	BTK	Q06187	659 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IHH	Q14623	411 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	VCX	Q9H320	206 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SP110	Q9HB58	689 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	COL6A2	P12110	1019 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TRIP10	Q15642	601 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KY	Q8NBH2	561 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PEX11B	O96011	259 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MT-CO1	P00395	513 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN8	P19075	237 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TYMP	P19971	482 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	RENBP	P51606	427 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	UROC1	Q96N76	676 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PRDX6	P30041	224 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ARSD	P51689	593 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	THOP1	P52888	689 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	GATA6	Q92908	595 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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