RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	GOT1	P17174	413 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADRA1B	P35368	520 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NR2C2	P49116	596 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINB9	P50453	376 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TLE2	Q04725	743 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ZBED5	Q49AG3	693 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MSS51	Q4VC12	460 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GPR180	Q86V85	440 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RIN3	Q8TB24	985 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM32	Q8TC27	787 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	EDEM1	Q92611	657 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TOX2	Q96NM4	488 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GID8	Q9NWU2	228 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TTC3	P53804	2025 aa		15.48	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TET1	Q8NFU7	2136 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659		H3BNH8	94 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A2	O15244	555 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GSTT2	P0CG29	244 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GSTT2B	P0CG30	244 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	KIT	P10721	976 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GRK2	P25098	689 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CNTF	P26441	200 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC11A1	P49279	550 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NEPRO	Q6NW34	567 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	BEND5	Q7L4P6	421 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RNF139	Q8WU17	664 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RTP4	Q96DX8	246 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	EBF4	Q9BQW3	602 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DDIT4	Q9NX09	232 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SCN5A	Q14524	2016 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659		A0A087WXM4	84 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF10B	O14763	440 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	KCNN4	O15554	427 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	BANF1	O75531	89 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	COL6A2	P12110	1019 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RBL1	P28749	1068 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2C18	P33260	490 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	STT3A	P46977	705 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CCR3	P51677	355 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GBE1	Q04446	702 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SCAP	Q12770	1279 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FLOT2	Q14254	428 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM60	Q495X7	471 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	HIPK4	Q8NE63	616 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	THAP11	Q96EK4	314 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NEURL2	Q9BR09	285 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MARCH5	Q9NX47	278 aa		15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PATJ	Q8NI35	1801 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	OR6C75	A6NL08	312 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	COX4I1	P13073	169 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FGFR3	P22607	806 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC5A3	P53794	718 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF280D	Q6N043	979 aa		15.46	■□□□□ 0.07

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