RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ACD	Q96AP0	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PAK5	Q9P286	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ANK1	P16157	1881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	GABRD	O14764	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	APOL1	O14791	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PPEF2	O14830	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CHUK	O15111	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TM9SF1	O15321	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	FLRT2	O43155	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TNFSF14	O43557	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ATP5H	O75947	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM63A	O94886	807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	UBOX5	O94941	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TGDS	O95455	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CLDN1	O95832	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PRKCH	P24723	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	LMO2	P25791	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	RBL1	P28749	1068 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PNPLA4	P41247	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ELK3	P41970	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	MSH2	P43246	934 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ETV4	P43268	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	MAGEA3	P43357	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	IFNAR2	P48551	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	RAB27A	P51159	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	DYNLT1	P63172	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ROR1	Q01973	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CREM	Q03060	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CRY1	Q16526	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CA9	Q16790	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	HSPH1	Q92598	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDM1-215	ENST00000612980	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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