RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATL2Q8NHH9 583 aa15.59■□□□□ 0.09
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RDH14Q9HBH5 336 aa15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.57■□□□□ 0.08
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AREL1O15033 823 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PMM2O15305 246 aa15.56■□□□□ 0.08
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.088e-6■□□□□ 8.4
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RMND1Q9NWS8 449 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RRN3Q9NYV6 651 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 P4HA2O15460 535 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTSS1O43312 755 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRKAR1AP10644 381 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SULT1E1P49888 294 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GNA12Q03113 381 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC63Q05C16 580 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAD51Q06609 339 aa15.55■□□□□ 0.08
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