RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592159.1

KDM4B-209, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4B, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-209ENST00000592159 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.86□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.86□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 NUP205Q92621 2012 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 EML5Q05BV3 1969 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 A0A0D9SEW6 157 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LNP1A1A4G5 178 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ILVBLA1L0T0 632 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PATE3B3GLJ2 98 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CBX4O00257 560 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MAP2K7O14733 419 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 BANF1O75531 89 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TMEM63AO94886 807 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MAGEA4P43358 317 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 IRX4P78413 519 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 IL10RBQ08334 325 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MTM1Q13496 603 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SEMA5AQ13591 1074 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SPARCL1Q14515 664 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF77Q15935 545 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 KYNUQ16719 465 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 EML3Q32P44 896 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MARC1Q5VT66 337 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ALS2CLQ60I27 953 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PMS2CLQ68D20 193 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 DENND2CQ68D51 928 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MFN1Q8IWA4 741 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PDIK1LQ8N165 341 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PGBD3Q8N328 593 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 DEFB124Q8NES8 71 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 OR52K2Q8NGK3 314 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 RIN3Q8TB24 985 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TEKT5Q96M29 485 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 GBA3Q9H227 469 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SLC32A1Q9H598 525 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 NT5MQ9NPB1 228 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 UBP1Q9NZI7 540 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PLAAQ9Y263 795 aa9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LAMA1P25391 3075 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 K7EQS6 105 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PSMD3O43242 534 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 KDELR3O43731 214 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PRAMEF11O60813 436 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ACSL3O95573 720 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 HLA-DQB2P05538 268 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TPSB2P20231 275 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 BCKDHBP21953 392 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MMP13P45452 471 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 RENBPP51606 427 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LMAN2Q12907 356 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 GPS2Q13227 327 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF235Q14590 738 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TPSAB1Q15661 275 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CNTD1Q8N815 330 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 RLN3Q8WXF3 142 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 C9orf72Q96LT7 481 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 ZIM3Q96PE6 472 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 IL12RB2Q99665 862 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.84□□□□□ -0.83
KDM4B-209ENST00000592159 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms