RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590977.5

EFTUD2-219, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 2,422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-219ENST00000590977 COPEO14579 308 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 AP2A1O95782 977 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ERVK-10P10266 1014 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PGAM1P18669 254 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MX2P20592 715 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CCR1P32246 355 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC11A1P49279 550 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 NUP107P57740 925 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 HTRA3P83110 453 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CDK18Q07002 472 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CHSY1Q86X52 802 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TTC17Q96AE7 1141 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 THTPAQ9BU02 230 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MARCH5Q9NX47 278 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 GMIPQ9P107 970 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SCML2Q9UQR0 700 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 FUOMA2VDF0 154 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TXNDC9O14530 226 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 KRT38O76015 456 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 VNN2O95498 520 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TBX18O95935 607 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 COL6A2P12110 1019 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TPH1P17752 444 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 NAT1P18440 290 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 BGNP21810 368 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SERPINB6P35237 376 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 VEGFBP49765 207 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 OVGP1Q12889 678 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TGFBIQ15582 683 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 LPCAT4Q643R3 524 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CYS1Q717R9 158 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ABI1Q8IZP0 508 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TEKT5Q96M29 485 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MECRQ9BV79 373 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CASS4Q9NQ75 786 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SYN3O14994 580 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PEX2P28328 305 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PMLP29590 882 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 HOXC13P31276 330 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CYP2C18P33260 490 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 GMPRP36959 345 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 BCAP31P51572 246 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PPP2R5DQ14738 602 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 ARHGEF6Q15052 776 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TLR1Q15399 786 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 CES4AQ5XG92 561 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 POTEHQ6S545 545 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 MON1AQ86VX9 555 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 RIN3Q8TB24 985 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SGF29Q96ES7 293 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 SCLYQ96I15 445 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 C8orf48Q96LL4 319 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 PLLPQ9Y342 182 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-219ENST00000590977 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms