RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FGF4	P08620	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC7A1	P30825	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NDUFV1	P49821	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	VAPB	O95292	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GRB14	Q14449	540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DDHD2	O94830	711 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ME2	P23368	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MYF6	P23409	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NKX3-2	P78367	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIP10	Q15642	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	OMD	Q99983	421 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PSMD3	O43242	534 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RECQL4	O94761	1208 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CYP11A1	P05108	521 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	HSD17B1	P14061	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SMPD1	P17405	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KCNA5	P22460	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ARL4A	P40617	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RAB10	P61026	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FEM1C	Q96JP0	617 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KLK8	O60259	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PIGN	O95427	931 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MATN4	O95460	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NFKB1	P19838	968 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NR1H2	P55055	460 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CDH17	Q12864	832 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.54	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	BAG2	O95816	211 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SQLE	Q14534	574 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GTF2A2	P52657	109 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms