RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577721.5

SMARCE1-212, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-212ENST00000577721 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 IGLON5A6NGN9 336 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 M0QYT0 321 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RAD51BO15315 384 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PAGE1O75459 146 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 LEFTY1O75610 366 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 IGLV3-25P01717 112 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ANXA6P08133 673 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GLI1P08151 1106 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 FSTP19883 344 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 NEK3P51956 506 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GCNT1Q02742 428 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 LRRC63Q05C16 580 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 MTA1Q13330 715 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 C1orf61Q13536 156 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SPIDRQ14159 915 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PERM1Q5SV97 790 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 FAXCQ5TGI0 409 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 LRRC31Q6UY01 552 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PARGQ86W56 976 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 NAT6Q93015 286 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SMARCE1Q969G3 411 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 HDAC8Q9BY41 377 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 WDCPQ9H6R7 721 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SPASTQ9UBP0 616 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GULP1Q9UBP9 304 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 VPS51Q9UID3 782 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 U3KQA8 63 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 A0A0D9SEW6 157 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RNF103O00237 685 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 AGRPO00253 132 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 TPP1O14773 563 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PSMA7O14818 248 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PMM2O15305 246 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 P4HA2O15460 535 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 HSF2BPO75031 334 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SRGAP2O75044 1071 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 TCEA3O75764 348 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 CNTN5O94779 1100 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ADRB3P13945 408 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GNA15P30679 374 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 OR1E1P30953 314 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 L1CAMP32004 1257 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 THOP1P52888 689 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 INHBCP55103 352 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SNX16P57768 344 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 NFKB2Q00653 900 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PDCLQ13371 301 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PTK2BQ14289 1009 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 FGL2Q14314 439 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ALFQ53S48 1182 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 RETSATQ6NUM9 610 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PASD1Q8IV76 773 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 EXD3Q8N9H8 876 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 WDR48Q8TAF3 677 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 LMO3Q8TAP4 145 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 CEP63Q96MT8 703 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 GSDMAQ96QA5 445 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-212ENST00000577721 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms