RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	COG5	Q9UP83	839 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CHD4	Q14839	1912 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A1B0GTW7	788 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZBED4	O75132	1171 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PROP1	O75360	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	UNC5C	O95185	931 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZWINT	O95229	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NDUFB10	O96000	172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SHBG	P04278	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP11B1	P15538	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	BPI	P17213	487 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ABCB4	P21439	1286 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FGFR4	P22455	802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	STX2	P32856	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GCK	P35557	465 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MXI1	P50539	228 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP2J2	P51589	502 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	HSD17B4	P51659	736 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	JAK3	P52333	1124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	STAT2	P52630	851 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PER3	P56645	1201 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TBX4	P57082	545 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MCL1	Q07820	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KCTD2	Q14681	263 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	APBB2	Q92870	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	GLG1	Q92896	1179 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CFDP1-208	ENST00000569341	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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