RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 GPR27Q9NS67 375 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 LHX3Q9UBR4 397 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 AK5Q9Y6K8 562 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 APC2O95996 2303 aa21.21■□□□□ 0.99
PPP4C-211ENST00000567642 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1B0GTH6 734 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 J3KR12 359 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PRPSAP2O60256 369 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 NEBLO76041 1014 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TM7SF2O76062 418 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PIGNO95427 931 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 GZMAP12544 262 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SKILP12757 684 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 MYF5P13349 255 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TIMP2P16035 220 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 NDST2P52849 883 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 E2F1Q01094 437 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 APOLD1Q96LR9 279 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PEBP4Q96S96 227 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM7Q9C029 511 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC19Q9H756 370 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DKK3Q9UBP4 350 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.2■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.981e-14■■■□□ 15.4
PPP4C-211ENST00000567642 SCAMP1O15126 338 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CSF2P04141 144 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 GIMD1P0DJR0 217 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 JUNDP17535 347 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PRKCIP41743 596 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 THOP1P52888 689 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP58Q5T655 872 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.19■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 K7ESM1 405 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PRAMEF11O60813 436 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CKMT1AP12532 417 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 MIPP30301 263 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 IGFALSP35858 605 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PFN3P60673 137 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SEMG2Q02383 582 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 IQCB1Q15051 598 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 RFX8Q6ZV50 586 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 LMX1AQ8TE12 382 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CENPTQ96BT3 561 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PDFQ9HBH1 243 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 KLF15Q9UIH9 416 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SCINQ9Y6U3 715 aa21.18■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DFFAO00273 331 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PALMO75781 387 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 MT-CO3P00414 261 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 ERCC2P18074 760 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TPM4P67936 248 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 ELP6Q0PNE2 266 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PTK2BQ14289 1009 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 GRM3Q14832 879 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 NR1I3Q14994 352 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 PAF1Q8N7H5 531 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 RFFLQ8WZ73 363 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM11Q96F44 468 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SP110Q9HB58 689 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.17■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 AQP9O43315 295 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 SUOXP51687 545 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
PPP4C-211ENST00000567642 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms