RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SUV39H1O43463 412 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PEX6Q13608 980 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MED22Q15528 200 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MEA1Q16626 185 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 C4orf46Q504U0 113 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LIPMQ5VYY2 423 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MREGQ8N565 214 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NAT14Q8WUY8 206 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 EXD2Q9NVH0 621 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DPP3Q9NY33 737 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 USP21Q9UK80 565 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CITO14578 2027 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 AVILO75366 819 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HMBSP08397 361 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PDHA2P29803 388 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CCR3P51677 355 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ALG5Q9Y673 324 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HBP1O60381 514 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RPS6KA4O75676 772 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 IRF1P10914 325 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC9A3P48764 834 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SPIBQ01892 262 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CSHL1Q14406 222 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SBK1Q52WX2 424 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 KLHL22Q53GT1 634 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 USP43Q70EL4 1123 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FBXO32Q969P5 355 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 IL1RAPQ9NPH3 570 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.13□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ADAMDEC1O15204 470 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GNRH1P01148 92 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CATP04040 527 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GLI1P08151 1106 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC26A2P50443 739 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CLCN5P51795 746 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TMEM17Q86X19 198 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 WDR49Q8IV35 697 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PHC3Q8NDX5 983 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GPIP06744 558 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NR2F1P10589 423 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CRATP43155 626 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RHEBQ15382 184 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TMEM192Q8IY95 271 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PHF21BQ96EK2 531 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CGRRF1Q99675 332 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NLRP1Q9C000 1473 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TULP3O75386 442 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CSPG5O95196 566 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 STAG3L1P0CL83 205 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 F8A1P23610 371 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MTM1Q13496 603 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FBXO30Q8TB52 745 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC22A4Q9H015 551 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FOXN1O15353 648 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RAD17O75943 681 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PIGNO95427 931 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CYB5AP00167 134 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TNNI3P19429 210 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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