RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	STRN	O43815	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC37A4	O43826	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT3	O95989	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GPD1	P21695	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BMP5	P22003	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CIITA	P33076	1130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DGKQ	P52824	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	HMGA2	P52926	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CSHL1	Q14406	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD2	Q14681	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PGM5	Q15124	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	STK38	Q15208	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EID2B	Q96D98	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAF1	Q9H063	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MYH6	P13533	1939 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MSH4	O15457	936 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ATP9A	O75110	1047 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PPP6R2	O75170	966 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	JTB	O76095	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	YEATS4	O95619	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PEPD	P12955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2B6	P20813	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CDC25A	P30304	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK4	P31152	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	COPB2	P35606	906 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PSMC4	P43686	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RENBP	P51606	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SP3	Q02447	781 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GRB14	Q14449	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	POSTN	Q15063	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		Q4G0T1	1027 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	USP6NL	Q92738	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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