RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 HSPH1Q92598 858 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DKK3Q9UBP4 350 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 USP24Q9UPU5 2620 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 H3BM21 787 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 MMP20O60882 483 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TM7SF2O76062 418 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ALPPL2P10696 532 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CKMT2P17540 419 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PCK1P35558 622 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 HNF1BP35680 557 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DAB2P98082 770 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 IFT43Q96FT9 208 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 THAP2Q9H0W7 228 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 AREL1O15033 823 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SPINT1O43278 529 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SIGLEC6O43699 453 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PIAS2O75928 621 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ELP6Q0PNE2 266 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PARGQ86W56 976 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SLC25A45Q8N413 288 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 NPWQ8N729 165 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ASB12Q8WXK4 309 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 VOPP1Q96AW1 172 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.72■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 NEMP2A6NFY4 417 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM38O00635 465 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 JUPP14923 745 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TIMP2P16035 220 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ITIH2P19823 946 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 HCAR3P49019 387 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SUOXP51687 545 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 THOP1P52888 689 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 BOLA3Q53S33 107 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TSC1Q92574 1164 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 NUP85Q9BW27 656 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ASPMQ8IZT6 3477 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 AKAP13Q12802 2813 aa24.71■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 A0A087X0T9 212 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 GYPCP04921 128 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 FAM228BP0C875 321 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 IL1R2P27930 398 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 IL10RBQ08334 325 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 DPYSQ14117 519 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 FZD2Q14332 565 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 AFMIDQ63HM1 303 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ERAP2Q6P179 960 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 PROSER1Q86XN7 944 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 LZTR1Q8N653 840 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 OR4C6Q8NH72 309 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 MDM1Q8TC05 714 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 BTBD6Q96KE9 485 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa24.7■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 TCF4P15884 667 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 SERPINA4P29622 427 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 CASP14P31944 242 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN6P56747 220 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ILKQ13418 452 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 PTK2BQ14289 1009 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 DPYSL2Q16555 572 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 UGP2Q16851 508 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 PROX2Q3B8N5 592 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 BRAT1Q6PJG6 821 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 SRLQ86TD4 932 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.69■■□□□ 1.54
PRKCH-216ENST00000555542 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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