RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 PBX3P40426 434 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CCR10P46092 362 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GALNT7Q86SF2 657 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SCYL1Q96KG9 808 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CAPNS2Q96L46 248 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 THTPAQ9BU02 230 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ACSS2Q9NR19 701 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CREBZFQ9NS37 354 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC42Q9Y546 428 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 A0A087X1B8 175 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MEI4A8MW99 385 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 F8W8V4 182 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ZBTB14O43829 449 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TRPA1O75762 1119 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PSMG1O95456 288 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GLDCP23378 1020 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MAP2K2P36507 400 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ACVRL1P37023 503 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MAPKAPK2P49137 400 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 NAGLUP54802 743 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 BFSP2Q13515 415 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 RCN1Q15293 331 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 C5orf22Q49AR2 442 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LSMEM2Q8N112 164 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GPATCH11Q8N954 259 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CALML6Q8TD86 181 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 A0A088AWK7 358 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 H7C4K7 107 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PIGNO95427 931 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 OR1E1P30953 314 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 HK2P52789 917 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 COPAP53621 1224 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SLC14A2Q15849 920 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CFAP157Q5JU67 520 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TMC7Q7Z402 723 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 AGR3Q8TD06 166 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GIPC2Q8TF65 315 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PANX3Q96QZ0 392 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 OR52B2Q96RD2 323 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 OLFM1Q99784 485 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TTPALQ9BTX7 342 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PDFQ9HBH1 243 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MUSKO15146 869 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 HDAC3O15379 428 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SLC7A4O43246 635 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GRID2O43424 1007 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PRAMEF11O60813 436 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 GJB3O75712 270 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TACR2P21452 398 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ARSDP51689 593 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 KCNQ1P51787 676 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A3Q00325 362 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PRKAA1Q13131 559 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 NAA25Q14CX7 972 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 STON2Q8WXE9 905 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 SEPT8Q92599 483 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMK1-208ENST00000538333 E9PBE3 544 aa14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms