RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALF	Q53S48	1182 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GGT7	Q9UJ14	662 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1B0GVL5	298 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MMP20	O60882	483 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CPNE6	O95741	557 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT5	P13647	590 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LIF	P15018	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PFKFB1	P16118	471 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CMA1	P23946	247 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GGCX	P38435	758 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABL2	P42684	1182 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNX16	P57768	344 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GCNT1	Q02742	428 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DPYD	Q12882	1025 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRC14	Q15048	493 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALG11	Q2TAA5	492 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DRGX	A6NNA5	263 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRIT1	O00522	736 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	AREL1	O15033	823 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PMM2	O15305	246 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTSS1	O43312	755 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	VPS4B	O75351	444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCL4	P13236	92 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	UGT1A3	P35503	534 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ETFB	P38117	255 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYK	P43405	635 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FMO5	P49326	533 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MC1R	Q01726	317 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDCL	Q13371	301 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFATC4	Q14934	902 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KAT5	Q92993	513 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6	3e-6	■■□□□ 12.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRBA	P50851	2863 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	P4HA2	O15460	535 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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