RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TPM4P67936 248 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ELP6Q0PNE2 266 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PTK2BQ14289 1009 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FZD2Q14332 565 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FIGNQ5HY92 759 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TTC7BQ86TV6 843 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RFFLQ8WZ73 363 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF653Q96CK0 615 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EXOC2Q96KP1 924 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PDFQ9HBH1 243 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 USP29Q9HBJ7 922 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LHX3Q9UBR4 397 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LHX6Q9UPM6 363 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCAMP1O15126 338 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DAPK3O43293 454 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PRAMEF11O60813 436 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GIMD1P0DJR0 217 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MYBL1P10243 752 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CKMT1AP12532 417 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 THOP1P52888 689 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CLDN6P56747 220 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PFN3P60673 137 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 E2F1Q01094 437 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CYP4F3Q08477 520 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NR1I3Q14994 352 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IQCB1Q15051 598 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CYTH1Q15438 398 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CFAP58Q5T655 872 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RFX8Q6ZV50 586 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PEBP4Q96S96 227 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SP110Q9HB58 689 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RAXQ9Y2V3 346 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ACACAQ13085 2346 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ITPR1Q14643 2758 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TSPAN11A1L157 253 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 J3KR12 359 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MMP20O60882 483 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LRCH4O75427 683 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PIGNO95427 931 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GP1BAP07359 652 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ERCC2P18074 760 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MIPP30301 263 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IGFALSP35858 605 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KNTC1P50748 2209 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 YPEL5P62699 121 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ACAP1Q15027 740 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CA9Q16790 459 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VPS36Q86VN1 386 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NETO2Q8NC67 525 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CENPTQ96BT3 561 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 APOLD1Q96LR9 279 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms