RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525043.4

C8orf49-201, Transcript of chromosome 8 open reading frame 49 (putative), humanhuman

BASIC

Gene C8orf49, Length 1,968 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49-201ENST00000525043 GPAT4Q86UL3 456 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 SHC3Q92529 594 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C8orf49-201ENST00000525043 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TKTL1P51854 596 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CNTN2Q02246 1040 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RAB39AQ14964 217 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 POTEAQ6S8J7 498 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 URGCPQ8TCY9 931 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 POLIQ9UNA4 740 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CHD4Q14839 1912 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 STK36Q9NRP7 1315 aa14.95□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TMEM82A0PJX8 343 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TRIM38O00635 465 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ERVK-8P63133 956 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CLCQ05315 142 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 GCKRQ14397 625 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ASIC2Q16515 512 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PODNQ7Z5L7 613 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 NOXA1Q86UR1 476 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 COMTD1Q86VU5 262 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ASB12Q8WXK4 309 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ST8SIA4Q92187 359 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CHFRQ96EP1 664 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 EYA1Q99502 592 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 GLRX2Q9NS18 164 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 HPF1Q9NWY4 346 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 SLIT2O94813 1529 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 FZD6O60353 706 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ADH1CP00326 375 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CYP2A7P20853 494 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 FGFR4P22455 802 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PTPREP23469 700 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 GRIA3P42263 894 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 FUT2Q10981 343 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 GRM7Q14831 915 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PLD5Q8N7P1 536 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ZNF527Q8NB42 609 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.94□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 KCNQ3O43525 872 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 APOL3O95236 402 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 IL1BP01584 269 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 ITGA4P13612 1032 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 SLC5A1P13866 664 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 CPOXP36551 454 aa14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C8orf49-201ENST00000525043 SLC1A4P43007 532 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms