RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 WDCPQ9H6R7 721 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 C2CD2Q9Y426 696 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TSC2P49815 1807 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA1BQ00975 2339 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LAMA1P25391 3075 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0B4J269 797 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 AHRRA9YTQ3 701 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 F2RL2O00254 374 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF263O14978 683 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 OGTO15294 1046 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC43A1O75387 559 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SBK3P0C264 359 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PLA2G4BP0C869 781 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CD72P21854 359 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GCSHP23434 173 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC6A2P23975 617 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GDI1P31150 447 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A3Q00325 362 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RABEP1Q15276 862 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA1Q5VX52 437 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CENPPQ6IPU0 288 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DENND1CQ8IV53 801 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FAM3CQ92520 227 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 BICD1Q96G01 975 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 NEU1Q99519 415 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RTKNQ9BST9 563 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ASB7Q9H672 318 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PARVGQ9HBI0 331 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 POLD4Q9HCU8 107 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 JKAMPQ9P055 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RAB23Q9ULC3 237 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TBX20Q9UMR3 447 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ANO9A1A5B4 782 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GAGE12BA1L429 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MTMR11A4FU01 709 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 K7ENM7 598 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FAM20BO75063 409 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 VNN2O95498 520 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RETP07949 1114 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CHRNB1P11230 501 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CDC25CP30307 473 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC6A4P31645 630 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 22.7
PDE4D-222ENST00000514552 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LIG4P49917 911 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PTTG1IPP53801 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ARPP19P56211 112 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LILRA4P59901 499 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GTF2BQ00403 316 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 VEPH1Q14D04 833 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TEAD2Q15562 447 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 HVCN1Q96D96 273 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CALML4Q96GE6 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GCNAQ96QF7 691 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CGRRF1Q99675 332 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 REEP2Q9BRK0 252 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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