RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TM7SF2O76062 418 aa17.13■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 TIMP2P16035 220 aa17.13■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 TGM2P21980 687 aa17.13■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 IGFALSP35858 605 aa17.13■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 GABREP78334 506 aa17.13■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 DKK3Q9UBP4 350 aa17.12■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 LHX3Q9UBR4 397 aa17.12■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 PARP15Q460N3 678 aa17.11■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.11■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.1■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.1■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 SHROOM3Q8TF72 1996 aa17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 LMO7DNF2Z398 122 aa17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 J3KR12 359 aa17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 ANXA6P08133 673 aa17.09■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 TSHRP16473 764 aa17.09■□□□□ 0.33
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