RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZWILCH	Q9H900	591 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	3e-7	■□□□□ 9.2
SH3BP2-222	ENST00000512014	DKK3	Q9UBP4	350 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN6	O43657	245 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM16	O95361	564 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD48	P09326	243 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	THEGL	P0DJG4	465 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKT2	P31751	481 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC18A3	Q16572	532 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPH1	Q92598	858 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	FEM1C	Q96JP0	617 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DONSON	Q9NYP3	566 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BRJ5	948 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DFFA	O00273	331 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	YKT6	O15498	198 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAPK3	O43293	454 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBFA2T2	O43439	604 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFSF14	O43557	240 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEC1	O60732	1142 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFAP3L	O75121	409 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPNS1	P04632	268 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GIMD1	P0DJR0	217 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSNK1D	P48730	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAS2R40	P59535	323 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL10RB	Q08334	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM14	Q14142	442 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A45	Q8N413	288 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXR1	Q8N573	874 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB12	Q8WXK4	309 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPT	Q96BT3	561 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NNZ2	444 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO1F	O00160	1098 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAFK	O60675	156 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP20	O60882	483 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDC3	O75056	442 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PALM	O75781	387 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROSC	O94903	275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPM3	P06753	285 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGAV	P06756	1048 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PROS1	P07225	676 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CR2	P20023	1033 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGFALS	P35858	605 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PFN3	P60673	137 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD51	Q06609	339 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	FZD2	Q14332	565 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZSR6	202 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRL	Q86TD4	932 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC7B	Q86TV6	843 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGBD5	Q8N414	524 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	EID2	Q8N6I1	236 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF15	Q9UIH9	416 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM38	O00635	465 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKCG	P05129	697 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	DGKA	P23743	735 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL4A	P40617	200 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36

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