RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511258.5

NSD1-211, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, human

TSL 3 BASIC

Gene NSD1, Length 809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD1-211	ENST00000511258	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NSD1-211	ENST00000511258	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	TACR2	P21452	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ADRA1B	P35368	520 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	DRD3	P35462	400 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CCZ1B	P86790	482 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	BUB1	O43683	1085 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	LRCH4	O75427	683 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PROSC	O94903	275 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CCDC175	P0C221	793 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MIP	P30301	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	GJC1	P36383	396 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	GGCX	P38435	758 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MYOC	Q99972	504 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PJA2	O43164	708 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PIAS2	O75928	621 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MTA2	O94776	668 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	MYF5	P13349	255 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	PCK1	P35558	622 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	AIF1	P55008	147 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	SKOR1	P84550	965 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NSD1-211	ENST00000511258	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.75	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms