RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SHISA7A6NL88 538 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PROB1E7EW31 1015 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 E9PAM4 449 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 H0Y8X5 98 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DCLK1O15075 740 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CHADO15335 359 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZSCAN12O43309 604 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SPOPO43791 374 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MFSD11O43934 449 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PRPSAP2O60256 369 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CACNG3O60359 315 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PPM1BO75688 479 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RNF8O76064 485 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NFATC1O95644 943 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FTCDO95954 541 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 F9P00740 461 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KRT1P04264 644 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GSNP06396 782 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HMBSP08397 361 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CD48P09326 243 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC2A3P11169 496 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ARSAP15289 507 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HDCP19113 662 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TACR2P21452 398 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PTPN7P35236 360 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GJC1P36383 396 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GNALP38405 381 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 VIPR2P41587 438 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CTSKP43235 329 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC11A2P49281 568 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HK2P52789 917 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZXDAP98168 799 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AMPD2Q01433 879 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NME3Q13232 169 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 BIRC2Q13490 618 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DPYSL3Q14195 570 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MESDQ14696 234 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PDGFRLQ15198 375 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TAZQ16635 292 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MPP7Q5T2T1 576 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CHST9Q7L1S5 443 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DAAM2Q86T65 1068 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC35F6Q8N357 371 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NPWQ8N729 165 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PRSS33Q8NF86 280 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DNASE1L2Q92874 299 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ATP2A3Q93084 1043 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AZIN2Q96A70 460 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 E2F7Q96AV8 911 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MSANTD3Q96H12 275 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HAPLN3Q96S86 360 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PRRX2Q99811 253 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TLR10Q9BXR5 811 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DCLK3Q9C098 648 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NACA2Q9H009 215 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GKN1Q9NS71 199 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PRR13Q9NZ81 148 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 COX16Q9P0S2 106 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 WHRNQ9P202 907 aa4.15□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.15□□□□□ -1.75
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