RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 CTNNA2P26232 953 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CDKN2BP42772 138 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PEX5P50542 639 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 NEK3P51956 506 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 DYNLT1P63172 113 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GBE1Q04446 702 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 IL10RBQ08334 325 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ADCY2Q08462 1091 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KIF19Q2TAC6 998 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KAZNQ674X7 775 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 AADACL2Q6P093 401 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 NPNTQ6UXI9 565 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 LZTR1Q8N653 840 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ALG3Q92685 438 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SERAC1Q96JX3 654 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TM4SF5O14894 197 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SLC31A1O15431 190 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TAZQ16635 292 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SRLQ86TD4 932 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TRIM69Q86WT6 500 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PLD5Q8N7P1 536 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 EXD1Q8NHP7 514 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 PREBQ9HCU5 417 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 FZD3Q9NPG1 666 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-214ENST00000498219 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 CCDC66A2RUB6 948 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 APOL1O14791 398 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 GIPC1O14908 333 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 SPINT1O43278 529 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 LATO43561 262 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 MAFKO60675 156 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 OPHN1O60890 802 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 PEX11BO96011 259 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 PRKCGP05129 697 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 SERPINB6P35237 376 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 SEMG2Q02383 582 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 RAD51Q06609 339 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 TEAD4Q15561 434 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 HLA-BQ31612 363 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 HORMAD1Q86X24 394 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 GAREM1Q9H706 876 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PR77 199 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 USP27XA6NNY8 438 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 ZNF487B1APH4 448 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 CST8O60676 142 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 PYGMP11217 842 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 TIMP2P16035 220 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 CD38P28907 300 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 GRIA4P48058 902 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 RWDD2BP57060 319 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 C21orf59P57076 290 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-214ENST00000498219 GALNT2Q10471 571 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms