RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HIDE1	A8MVS5	230 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TSPAN6	O43657	245 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM63A	O94886	807 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	BPNT1	O95861	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	IGLV3-19	P01714	112 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CCNB1	P14635	433 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	IGFBP4	P22692	258 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZXDB	P98169	803 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ATP11A	P98196	1134 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HYAL1	Q12794	435 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PRPSAP1	Q14558	356 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	IER5L	Q5T953	404 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CNTD1	Q8N815	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517		H0Y858	1186 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	RHO	P08100	348 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	COL6A2	P12110	1019 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CA4	P22748	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	GPX6	P59796	221 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HIF1A	Q16665	826 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CGB2	Q6NT52	195 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TTC23L	Q6PF05	361 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	AHI1	Q8N157	1196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TOR1B	O14657	336 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PRRG1	O14668	218 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	MAGEA4	P43358	317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HK2	P52789	917 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CDH17	Q12864	832 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	IFT88	Q13099	833 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZBTB17	Q13105	803 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PPP1R7	Q15435	360 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CYTH1	Q15438	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TCF12	Q99081	682 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TDP1	Q9NUW8	608 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CLEC1B	Q9P126	229 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	HAO1	Q9UJM8	370 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CDH7	Q9ULB5	785 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	TMCO1	Q9UM00	188 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	SLC12A8	A0AV02	714 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	AP1G1	O43747	822 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	RAMP2	O60895	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CDH16	O75309	829 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	METTL18	O95568	372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM41-208	ENST00000495517	CCR2	P41597	374 aa		6.97	□□□□□ -1.29

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