RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NMBRP28336 390 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 EMC10Q5UCC4 262 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 NCEH1Q6PIU2 408 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TRIB3Q96RU7 358 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TM6SF2Q9BZW4 377 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF180Q9UJW8 692 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CA4P22748 312 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 AP1S1P61966 158 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 NAB1Q13506 487 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TANGO2Q6ICL3 276 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SRLQ86TD4 932 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 AHI1Q8N157 1196 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.923e-6■■■□□ 16.3
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYVE19Q96K21 471 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF778Q96MU6 729 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RANBP9Q96S59 729 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ZFATQ9P243 1243 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CHKBQ9Y259 395 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RAI2Q9Y5P3 530 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC78A2IDD5 438 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ERVK-10P10266 1014 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ARSAP15289 507 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ATP1A2P50993 1020 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ECT2LQ008S8 904 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 GALNT3Q14435 633 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PDGFRLQ15198 375 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RASSF3Q86WH2 238 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MYADMQ96S97 322 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 EBF3Q9H4W6 596 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO10Q9UK96 956 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 REV3LO60673 3130 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FOXO6A8MYZ6 492 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SRCP12931 536 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ALADP13716 330 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MAPK8P45983 427 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RGS19P49795 217 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 STK19P49842 368 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 GRIN2CQ14957 1233 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 LGSNQ5TDP6 509 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ADIPOR2Q86V24 386 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TRABD2AQ86V40 505 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRE3Q9BY15 652 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SENP1Q9P0U3 644 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ACTL7BQ9Y614 415 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF6O95976 241 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MTHFRP42898 656 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CSNK1DP48730 415 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 DGKGP49619 791 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 RMDN1Q96DB5 314 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FAM83CQ9BQN1 747 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PAMP19021 973 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 LAMB3Q13751 1172 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MBLAC2Q68D91 279 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 VITQ6UXI7 678 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 KCNMB4Q86W47 210 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SELENOSQ9BQE4 189 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PPC1 479 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 UGT1A9O60656 530 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FAM155BO75949 473 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 KRT37O76014 449 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 DGKKQ5KSL6 1271 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 PDPK2PQ6A1A2 396 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP9Q7RTR0 991 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 MFSD6LQ8IWD5 586 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 YAF2Q8IY57 180 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TNKS2Q9H2K2 1166 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 UGT1A7Q9HAW7 530 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 UGT1A10Q9HAW8 530 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 UGT1A8Q9HAW9 530 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TXNDC16Q9P2K2 825 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM24O15164 1050 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINB9P50453 376 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXB3-210ENST00000489475 FCHO2Q0JRZ9 810 aa27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms