RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NFKBIAP25963 317 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CD68P34810 354 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ITKQ08881 620 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SPEM2Q0P670 501 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MTAPQ13126 283 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CUL1Q13616 776 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MORF4L2Q15014 288 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TPSAB1Q15661 275 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PPM1JQ5JR12 505 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EOGTQ5NDL2 527 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SRLQ86TD4 932 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 IFT20Q8IY31 132 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ARRDC2Q8TBH0 407 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 USP33Q8TEY7 942 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SPOCK2Q92563 424 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CLDN23Q96B33 292 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GABRG3Q99928 467 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RAB23Q9ULC3 237 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SHISA7A6NL88 538 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 K7ERQ8 282 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SUN1O94901 812 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 AP2A1O95782 977 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EGFP01133 1207 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRNPP04156 253 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C7P10643 843 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IVDP26440 423 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA4P29622 427 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SCNN1BP51168 640 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 BCL2L1Q07817 233 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MESP2Q0VG99 397 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CBLBQ13191 982 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 STARD3Q14849 445 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MYLK3Q32MK0 819 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TEX35Q5T0J7 233 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CHPFQ8IZ52 775 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PGBD5Q8N414 524 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MCUQ8NE86 351 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TMIEQ8NEW7 156 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NELL1Q92832 810 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PTPRN2Q92932 1015 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SEMA3CQ99985 751 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TTC34A8MYJ7 566 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MUSKO15146 869 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 METTL18O95568 372 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CHRNB1P11230 501 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MLNP12872 115 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PSMB4P28070 264 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF8P28908 595 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IL12RB1P42701 662 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LMAN1P49257 510 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms