RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM157A	C9JC47	383 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036		F8W810	466 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SEC14L2	O76054	403 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TMCC1	O94876	653 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	LCK	P06239	509 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CD63	P08962	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CTSA	P10619	480 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CPOX	P36551	454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CLCNKB	P51801	687 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CLDN2	P57739	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	STIM1	Q13586	685 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ALG11	Q2TAA5	492 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TXNDC8	Q6A555	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ISM2	Q6H9L7	571 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CDC73	Q6P1J9	531 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	AAGAB	Q6PD74	315 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CADM3	Q8N126	398 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
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FAM208A-208	ENST00000487036	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
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FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
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FAM208A-208	ENST00000487036		A6NNC1	897 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	AGAP14	A8MT82	685 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SNAP23	O00161	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	EBAG9	O00559	213 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	AHCYL1	O43865	530 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	PAGE4	O60829	102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	IL1A	P01583	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
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FAM208A-208	ENST00000487036	CENPA	P49450	140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	HDAC4	P56524	1084 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	OLR1	P78380	273 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	TOMM20	Q15388	145 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ALG10	Q5BKT4	473 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	GPAT4	Q86UL3	456 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	GPSM1	Q86YR5	675 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	PELI3	Q8N2H9	469 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	KDM1B	Q8NB78	822 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	USP6NL	Q92738	828 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	CUL5	Q93034	780 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FAM208A-208	ENST00000487036	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87

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