RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 11.3
CCSAP-204ENST00000483092 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DHFR2Q86XF0 187 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PQLC3Q8N755 202 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RNF39Q9H2S5 420 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ASB7Q9H672 318 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.38■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MGAMO43451 1857 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KRBA1A5PL33 1030 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN5O00501 218 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NCAM1P13591 858 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC26A2P50443 739 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A2P52569 658 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PLK1P53350 603 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf80Q86SX3 495 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LGMNQ99538 433 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SMOXQ9NWM0 555 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GSRP00390 522 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SMPD1P17405 629 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2F1P24903 491 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KIF19Q2TAC6 998 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SIX5Q8N196 739 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ADI1Q9BV57 179 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SIAEQ9HAT2 523 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SCN1AP35498 2009 aa16.37■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD11O00231 422 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN15O75808 1086 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TPH1P17752 444 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN8P19075 237 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PID1Q7Z2X4 250 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 EHD1Q9H4M9 534 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RECQL4O94761 1208 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IDO1P14902 403 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH4A1P30038 563 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GP5P40197 560 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PRKCQQ04759 706 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC185Q8N715 623 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SEPHS2Q99611 448 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FANCEQ9HB96 536 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SYBUQ9NX95 663 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C2P06681 752 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CDK18Q07002 472 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PPIL2Q13356 520 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCL15Q16663 113 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GABBR2O75899 941 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IL4RP24394 825 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MARCH7Q9H992 704 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PADI4Q9UM07 663 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK1O00180 336 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 AGRPO00253 132 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF195O14628 629 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 POLBP06746 335 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GOT1P17174 413 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IL10P22301 178 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CNTFP26441 200 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM17P78536 824 aa16.35■□□□□ 0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC6A3Q01959 620 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms