RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	CTPS1	P17812	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NFKBIA	P25963	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CDA	P32320	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TTK	P33981	857 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PRAME	P78395	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	OLIG2	Q13516	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SHB	Q15464	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PERP	Q96FX8	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		E5RJQ4	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AP3D1	O14617	1153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CELA2A	P08217	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CRYM	Q14894	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CADM3	Q8N126	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PDILT	Q8N807	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RNF183	Q96D59	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		A0A0G2JK05	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		A0A1W2PQF6	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HSPB6	O14558	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SCAMP1	O15126	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KLKB1	P03952	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	EPHB2	P29323	1055 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GNAQ	P50148	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HDAC4	P56524	1084 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CREB5	Q02930	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SGCD	Q92629	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	VILL	O15195	856 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FIBP	O43427	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	LIAS	O43766	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMCC2	O75069	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms