RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PYGB	P11216	843 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK3	P51956	506 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC18A2	Q05940	514 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GRTP1	Q5TC63	336 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IRF7	Q92985	503 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ACD	Q96AP0	544 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GDF15	Q99988	308 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MKS1	Q9NXB0	559 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	COPE	O14579	308 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TPP1	O14773	563 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TM9SF1	O15321	606 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RFPL1	O75677	317 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	VAPB	O95292	243 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ASMTL	O95671	621 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKCG	P05129	697 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ALAD	P13716	330 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARNT	P27540	789 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PLK1	P53350	603 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LIMK2	P53671	638 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IL9R	Q01113	521 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LAMB3	Q13751	1172 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNC3	Q14003	757 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	HHAT	Q5VTY9	493 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	OTUB2	Q96DC9	234 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	LMLN	Q96KR4	655 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42	1e-6	■■■□□ 15
HDLBP-231	ENST00000467435	GGT7	Q9UJ14	662 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDLBP-231	ENST00000467435	MROH6	A6NGR9	719 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435		K7ERQ8	282 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	RFXAP	O00287	272 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	TIMM44	O43615	452 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	LDB2	O43679	373 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	SIN3B	O75182	1162 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM107A	O95990	144 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-CO1	P00395	513 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	TYR	P14679	529 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	FSHR	P23945	695 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDLBP-231	ENST00000467435	WEE1	P30291	646 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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