RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAGEA3P43357 314 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SOX9P48436 509 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GALNT3Q14435 633 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POU6F1Q14863 301 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DLG2Q15700 870 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GAB4Q2WGN9 574 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RANBP10Q6VN20 620 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PAF1Q8N7H5 531 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRRC39Q96DD0 335 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC25Q96NG3 672 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CASS4Q9NQ75 786 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYBUQ9NX95 663 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHKBQ9Y259 395 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.49□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMIM23A6NLE4 172 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRRT4C9JH25 899 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AP3B1O00203 1094 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP8B1O43520 1251 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGSF6O95976 241 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CES1P23141 567 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GKP32189 559 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OPRD1P41143 372 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NPY2RP49146 381 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPX6P59796 221 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ST8SIA6P61647 398 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDK18Q07002 472 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SEPT6Q14141 434 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC1A5Q15758 541 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALS2CLQ60I27 953 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CES3Q6UWW8 571 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 Q6ZVU0 165 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SRLQ86TD4 932 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IQCKQ8N0W5 287 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TERB1Q8NA31 727 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NXPE3Q969Y0 559 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC17Q96AE7 1141 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TADA1Q96BN2 335 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RMDN1Q96DB5 314 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHFRQ96EP1 664 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IL22Q9GZX6 179 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CENPHQ9H3R5 247 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNK12Q9HB15 430 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYO10Q9HD67 2058 aa6.48□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 F5P12259 2224 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TLDC2A0PJX2 215 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC34A8MYJ7 566 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARNTLO00327 626 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIAS1O75925 651 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIGNO95427 931 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ASGR2P07307 311 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDHA1P08559 390 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIRTP0C851 137 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHBP35232 272 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLCO1A2P46721 670 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AP1S1P61966 158 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TFF2Q03403 129 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCL2L1Q07817 233 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms