RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 FZD3Q9NPG1 666 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMTS20P59510 1910 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 J3KR12 359 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SCAMP1O15126 338 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RAD51BO15315 384 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SIGLEC6O43699 453 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PRAMEF11O60813 436 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PALMO75781 387 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PIAS2O75928 621 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TM7SF2O76062 418 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CSF2P04141 144 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SERPING1P05155 500 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ERCC2P18074 760 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PCK1P35558 622 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HNF1BP35680 557 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PBX1P40424 430 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ABL2P42684 1182 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ACADVLP49748 655 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZBED6P86452 979 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ELP6Q0PNE2 266 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJC3Q13217 504 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PTK2BQ14289 1009 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PROX2Q3B8N5 592 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 AFMIDQ63HM1 303 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RFX8Q6ZV50 586 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 OR4C6Q8NH72 309 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF653Q96CK0 615 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MYOCQ99972 504 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 USP29Q9HBJ7 922 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GPR27Q9NS67 375 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LHX3Q9UBR4 397 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CACNA1GO43497 2377 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SYCE3A1L190 88 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CFAP69A5D8W1 941 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 H3BM21 787 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM38O00635 465 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 TPP1O14773 563 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 INSIG1O15503 277 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 MMP20O60882 483 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SDC3O75056 442 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LRCH4O75427 683 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 GIMD1P0DJR0 217 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CKMT1AP12532 417 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 ARL4AP40617 200 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PEX5P50542 639 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RENBPP51606 427 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PFN3P60673 137 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 DAB2P98082 770 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 IL10RBQ08334 325 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CYP4F3Q08477 520 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 FZD2Q14332 565 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CA9Q16790 459 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 UGP2Q16851 508 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 HGSNATQ68CP4 663 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SRLQ86TD4 932 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 LUZP1Q86V48 1076 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 PARGQ86W56 976 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRF-210ENST00000463041 RFFLQ8WZ73 363 aa7.36□□□□□ -1.23
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