RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 SMIM29Q86T20 159 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 MTBPQ96DY7 904 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 OR1F2PQ96R84 312 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 EPYCQ99645 322 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.6□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 hDV102S1A0JD36 115 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 STX16O14662 325 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 XPNPEP2O43895 674 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 PMS2P2O95744 297 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TFPIP10646 304 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TNNT1P13805 278 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 DGKAP23743 735 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TTKP33981 857 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 UBE4AQ14139 1066 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 BRD3Q15059 726 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 FBXL22Q6P050 247 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 CCDC174Q6PII3 467 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 THAP4Q8WY91 577 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 HSPH1Q92598 858 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 LRFN5Q96NI6 719 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 CD207Q9UJ71 328 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC3-211ENST00000460328 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ATP2C2O75185 946 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 KDM4BO94953 1096 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ADD2P35612 726 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 LIFRP42702 1097 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SLC18A3Q16572 532 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TUBA1AQ71U36 451 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CD101Q93033 1021 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SLC39A13Q96H72 371 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 DERAQ9Y315 318 aa3.58□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 FAM155BO75949 473 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RGS11O94810 467 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CGAP01215 116 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TK1P04183 234 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 PIGAP37287 484 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CXCR3P49682 368 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HDAC4P56524 1084 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 NLRP5P59047 1200 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SHFQ7M4L6 423 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 AFG1LQ8WV93 481 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RILPL2Q969X0 211 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CSF3RQ99062 836 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.57□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CPED1A4D0V7 1026 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 EBAG9O00559 213 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 HSPA12AO43301 675 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GAGE7O76087 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 CLDN14O95500 239 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GAGE12FP0CL80 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GAGE12GP0CL81 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 GAGE12IP0CL82 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC3-211ENST00000460328 RXRAP19793 462 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms