RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FAM47BQ8NA70 645 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NACA2Q9H009 215 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DRC3Q9H069 523 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PAK5Q9P286 719 aa17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 THP07101 528 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CD247P20963 164 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NEK2P51955 445 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 BNIP3Q12983 259 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB17Q13105 803 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SLC29A1Q99808 456 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 WDR41Q9HAD4 459 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 J3QRK9 145 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 POMCP01189 267 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PSMA2P25787 234 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC52Q8N7C0 313 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 FBXL8Q96CD0 374 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RCN3Q96D15 328 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC138Q96M89 665 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM161AQ9NX61 479 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 COPG2Q9UBF2 871 aa17.01■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KRBA1A5PL33 1030 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SNAP91O60641 907 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DPP6P42658 865 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RAP1GAPP47736 663 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NHSL2Q5HYW2 709 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GPR107Q5VW38 600 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF354CQ86Y25 554 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SLC15A4Q8N697 577 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KCTD6Q8NC69 237 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LRTOMTQ8WZ04 291 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TANKQ92844 425 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 OR52B2Q96RD2 323 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PAAF1Q9BRP4 392 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 SLC22A2O15244 555 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 B4GALT3O60512 393 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LRCH4O75427 683 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ERBB2P04626 1255 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CDH8P55286 799 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT2Q10471 571 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRSQ13332 1948 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ITGADQ13349 1161 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 COL4A6Q14031 1691 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM16LQ309B1 348 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TNIP2Q8NFZ5 429 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK15Q8TD08 544 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TAMM41Q96BW9 452 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CISHQ9NSE2 258 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CORINQ9Y5Q5 1042 aa17■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PFDN6O15212 129 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CSPG5O95196 566 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PRKCGP05129 697 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CSF2RAP15509 400 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 JAK1P23458 1154 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RFC2P35250 354 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF132P52740 706 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ART3Q13508 389 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NOMO1Q15155 1222 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 INSCQ1MX18 579 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TFAP2CQ92754 450 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 TPP1O14773 563 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 NDUFB5O43674 189 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 CLCNKBP51801 687 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PMS2P3Q13401 168 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 PHKG1Q16816 387 aa16.99■□□□□ 0.31
CNGA3-205ENST00000436404 C6orf183Q5T699 404 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms