RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RRADP55042 308 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFEMP1Q12805 493 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRF1Q5T601 910 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GFRALQ6UXV0 394 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SKAP1Q86WV1 359 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUFY1Q96T51 708 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX25Q9H3E2 840 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARMCX1Q9P291 453 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAGPAQ9UK23 515 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B4DGG1 531 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CREB3O43889 395 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBL1XO60907 577 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0754O94854 1291 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LATS1O95835 1130 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MT-ND3P03897 115 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM163BP0C2L3 166 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM49P0CI25 452 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM49CP0CI26 452 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLS3P13797 630 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCD5Q86SK9 330 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMOQ99835 787 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PP2D1A8MPX8 630 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H0YCG3 227 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AP1G2O75843 785 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MOCS3O95396 460 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF18P17022 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC12A3P55017 1021 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFA6Q01524 100 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SGCGQ13326 291 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HDAC8Q9BY41 377 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPAMQ9HCL2 828 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP83Q9Y592 693 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BEST1O76090 585 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATE1O95260 518 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAF1P04049 648 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGFALSP35858 605 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYCP1Q15431 976 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERMNQ8TAM6 284 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF31Q96EP0 1072 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MED10Q9BTT4 135 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIPINQ9BVW5 301 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF3AQ9Y496 699 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A8MU76 341 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFA10O95299 355 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTSLP07711 333 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNAR1P17181 557 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSX1P28360 303 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCKAP1LP55160 1127 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASP6P55212 293 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDC16Q13042 620 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYBPC3Q14896 1274 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KYNUQ16719 465 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NACC2Q96BF6 587 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HPDLQ96IR7 371 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BDH2Q9BUT1 245 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms