RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TPM2P07951 284 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SFTPCP11686 197 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FDXRP22570 491 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GRK6P43250 576 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IFNAR2P48551 515 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 EVCP57679 992 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MYO1EQ12965 1108 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TFDP1Q14186 410 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 Q96MF0 132 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 UROC1Q96N76 676 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ECT2Q9H8V3 914 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IL21RQ9HBE5 538 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TLK1Q9UKI8 766 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TBX20Q9UMR3 447 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ASB3Q9Y575 518 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0D9SFI3 127 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ANO9A1A5B4 782 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MEI4A8MW99 385 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FAM86B1E9PN63 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF217O75362 1048 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MATN4O95460 622 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF12O95522 483 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ARSAP15289 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6KB1P23443 525 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRK-211ENST00000429595 BRCC3P46736 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 NAPAP54920 295 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 OCA2Q04671 838 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TLE1Q04724 770 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-BQ31612 363 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF280DQ6N043 979 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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PTPRK-211ENST00000429595 ALLCQ8N6M5 410 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM143Q96AN5 459 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DPH1Q9BZG8 443 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IL25Q9H293 177 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY26PQ9H489 355 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 USP25Q9UHP3 1055 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MTMR6Q9Y217 621 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 YIPF1Q9Y548 306 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PI4KAP42356 2102 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 NOTCH2Q04721 2471 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM150BA6NC51 233 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.59□□□□□ -1.35
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PTPRK-211ENST00000429595 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV2-14P01704 120 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PTPN7P35236 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CLCNKBP51801 687 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 VEPH1Q14D04 833 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 UGCGQ16739 394 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZVL8 140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 USP49Q70CQ1 688 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MED25Q71SY5 747 aa6.59□□□□□ -1.35
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