RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 COL4A6Q14031 1691 aa20.36■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF195O14628 629 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 LATS1O95835 1130 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINB5P36952 375 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLC26A3P40879 764 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MAXP61244 160 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GPR65Q8IYL9 337 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 RILPQ96NA2 401 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MIPEPQ99797 713 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 DRC3Q9H069 523 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf21Q9H246 121 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT3Q9UH03 358 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CEP350Q5VT06 3117 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ILVBLA1L0T0 632 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 H3BNC9 293 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GYG2O15488 501 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLC6A4P31645 630 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ACVRL1P37023 503 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ABCG1P45844 678 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 WLSQ5T9L3 541 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.35■□□□□ 0.85
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SUMO3-204ENST00000411651 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GPR78Q96P69 363 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 PSKH2Q96QS6 385 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SEMA3CQ99985 751 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 NACA2Q9H009 215 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CDH19Q9H159 772 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.35■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GSC2O15499 205 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 COCHO43405 550 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA4LO95757 839 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINF2P08697 491 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ARRB2P32121 409 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ETFBP38117 255 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 IHHQ14623 411 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 EBF4Q9BQW3 602 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 TBX21Q9UL17 535 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC78A2IDD5 438 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 KDELR3O43731 214 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SBK3P0C264 359 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CCL5P13501 91 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLC12A2P55011 1212 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GPR150Q8NGU9 434 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 AGAP11Q8TF27 550 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 IFT43Q96FT9 208 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 CD248Q9HCU0 757 aa20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SUMO3-204ENST00000411651 LTBP2Q14767 1821 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1B0GVM2 712 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 LDB2O43679 373 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 MAGEC1O60732 1142 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 ALDH1A3P47895 512 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 IDH3AP50213 366 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 TAS2R39P59534 338 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJB13P59910 316 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 RAB33AQ14088 237 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 VEPH1Q14D04 833 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 MAVSQ7Z434 540 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 TREML1Q86YW5 311 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 CEP97Q8IW35 865 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 TEX9Q8N6V9 391 aa20.33■□□□□ 0.84
SUMO3-204ENST00000411651 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.33■□□□□ 0.84
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