RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384285.2

RNU6-72P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 72, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-72P, Length 79 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-72P-201ENST00000384285 CDH12P55289 794 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 HDAC4P56524 1084 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 MED22Q15528 200 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 HSPB2Q16082 182 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 CCNG2Q16589 344 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 EPHA10Q5JZY3 1008 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 TXNDC8Q6A555 127 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 NCAPH2Q6IBW4 605 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 CFAP161Q6P656 301 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 IKBIPQ70UQ0 350 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 FRMD1Q8N878 549 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 MCPH1Q8NEM0 835 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 GJC3Q8NFK1 279 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 GTF3C6Q969F1 213 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 FAM149B1Q96BN6 582 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 COQ8BQ96D53 544 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 YME1L1Q96TA2 773 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 MUC13Q9H3R2 512 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 SLC6A13Q9NSD5 602 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 DECR2Q9NUI1 292 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 HEY2Q9UBP5 337 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 PCDHA12Q9UN75 941 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 ZNF804BA4D1E1 1349 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-72P-201ENST00000384285 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 DYTNA2CJ06 578 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 KLRF2D3W0D1 207 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 USP17L23D6RBM5 183 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ATG13O75143 517 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 MLYCDO95822 493 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 IFNA2P01563 188 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 FGBP02675 491 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 KLKB1P03952 638 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 KRT10P13645 584 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PRF1P14222 555 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 CHRNB2P17787 502 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 SRD5A1P18405 259 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 GABRB2P47870 512 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 C21orf58P58505 322 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 GRIK3Q13003 919 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PRKG2Q13237 762 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ARHGEF6Q15052 776 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 RABEP1Q15276 862 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ESCO2Q56NI9 601 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 MANEAQ5SRI9 462 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PXDC1Q5TGL8 231 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TTI2Q6NXR4 508 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TSSK4Q6SA08 328 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 LCTLQ6UWM7 567 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PALB2Q86YC2 1186 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TMEM199Q8N511 208 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TMEM116Q8NCL8 245 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 DENND1AQ8TEH3 1009 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 CREB3L4Q8TEY5 395 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 USP6NLQ92738 828 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 TMEM18Q96B42 140 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-72P-201ENST00000384285 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms