RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ASB9Q96DX5 294 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CNPY3Q9BT09 278 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCHPQ9BT92 498 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LGR4Q9BXB1 951 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HIPK3Q9H422 1215 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APPL1Q9UKG1 709 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GJD2Q9UKL4 321 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PCNTO95613 3336 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 COL1A2P08123 1366 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 H3BNH8 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC3O15379 428 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CSH1P0DML2 217 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CSH2P0DML3 217 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TCF4P15884 667 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2B6P20813 491 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA1P21709 976 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GLDCP23378 1020 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CDH6P55285 790 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BCAR1P56945 870 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 STX5Q13190 355 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PCLAFQ15004 111 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EMC2Q15006 297 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DGKDQ16760 1214 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GRTP1Q5TC63 336 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 IYDQ6PHW0 289 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DSELQ8IZU8 1212 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HIPK4Q8NE63 616 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ISL2Q96A47 359 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RNF157Q96PX1 679 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OLFM1Q99784 485 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CPNE1Q99829 537 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF670Q9BS34 389 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CISHQ9NSE2 258 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GIN1Q9NXP7 522 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HACD1B0YJ81 288 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 K7ERI5 159 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3R2O00459 728 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM38O00635 465 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CYB561D2O14569 222 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AOC2O75106 756 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ATE1O95260 518 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PGAM1P18669 254 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GPD1P21695 349 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FGFR3P22607 806 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MIPP30301 263 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GP5P40197 560 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CPT1AP50416 773 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OXCT1P55809 520 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MMRN1Q13201 1228 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA5AQ13591 1074 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM110Q86TL2 294 aa7.27□□□□□ -1.25
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