RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 SPATC1Q76KD6 591 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 KLHL3Q9UH77 587 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.51■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TMCC2O75069 709 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 BMP10O95393 424 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 KRT8P05787 483 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PRKACBP22694 351 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 EDNRBP24530 442 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 IFNA8P32881 189 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ICAM3P32942 547 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ADCK1Q86TW2 530 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 FAM35AQ86V20 835 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 RNF135Q8IUD6 432 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 DDIASQ8IXT1 998 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ZNF516Q92618 1163 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CYP4F12Q9HCS2 524 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 M0R3G1 203 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TK2O00142 265 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TOMM70O94826 608 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PCNAP12004 261 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TNFSF9P41273 254 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SLC7A2P52569 658 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CCNA1P78396 465 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TTLL4Q14679 1199 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ARCQ7LC44 396 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ZNF597Q96LX8 424 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 DACH2Q96NX9 599 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 B4GALT5O43286 388 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TBX1O43435 398 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MGEA5O60502 916 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 GLRA3O75311 464 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SNAP29O95721 258 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 IFITM2Q01629 132 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MERTKQ12866 999 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MADCAM1Q13477 382 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CST9Q5W186 159 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ITPKCQ96DU7 683 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MROH8Q9H579 483 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 GPC4O75487 556 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CDH1P12830 882 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 FMO4P31512 558 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PLIN5Q00G26 463 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 FUT11Q495W5 492 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 SNX19Q92543 992 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 OMA1Q96E52 524 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CTRCQ99895 268 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TASP1Q9H6P5 420 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 NANOGQ9H9S0 305 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 NEK6Q9HC98 313 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 E7ESA3 106 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TRIM38O00635 465 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 TEX28O15482 410 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 LRCH4O75427 683 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 DAB1O75553 588 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 VTNP04004 478 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CYP2B6P20813 491 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 CES1P23141 567 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 GPC3P51654 580 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 C11orf74Q86VG3 221 aa15.49■□□□□ 0.07
TTC13-201ENST00000366661 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms