RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGER3P43115 390 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEK2P51955 445 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSHL1Q14406 222 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFNB3Q15768 340 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF212Q495C1 297 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 STXBP5Q5T5C0 1151 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF220Q5VTB9 566 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFMBT2Q5VUG0 894 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 GFRALQ6UXV0 394 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM64Q6YI46 380 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF852Q6ZMS4 543 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR5BQ86VZ2 330 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM219Q86XT9 240 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARRDC2Q8TBH0 407 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CREB3L4Q8TEY5 395 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 THAP4Q8WY91 577 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQCDQ96DY2 449 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRFN5Q96NI6 719 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC1Q9BTT6 524 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFT27Q9BW83 186 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HDHD5Q9BXW7 423 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM118AQ9NWS6 357 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 BARHL2Q9NY43 387 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 CACNG5Q9UF02 275 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC12A4Q9UP95 1085 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAM16Q9Y3D7 125 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PPI3 338 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFNL4K9M1U5 179 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLIM4O00461 696 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH17O14917 1159 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 AREL1O15033 823 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPA12AO43301 675 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFS7O75251 213 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLSTN1O94985 981 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYL4P12829 197 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA2P17301 1181 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFAIP2Q03169 654 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA9Q13797 1035 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRM4Q14833 912 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 AMZ1Q400G9 498 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAF6Q58WW2 860 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCAPH2Q6IBW4 605 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF613Q6PF04 617 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF790Q6PG37 636 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD8Q6ZWB6 473 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHFQ7M4L6 423 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRABD2AQ86V40 505 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC30AQ86WT1 665 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGKHQ86XP1 1220 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DSELQ8IZU8 1212 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 STPG4Q8N801 248 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2CD4CQ8TF44 421 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TM9SF4Q92544 642 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYT11Q9BT88 431 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGF22Q9HCT0 170 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM181Q9P2C4 612 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 UPB1Q9UBR1 384 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAN1B1Q9UKM7 699 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 LZTS1Q9Y250 596 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3EA0A087X179 549 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A096LPK6 155 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3BA6NDS4 549 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM247A6NEH6 219 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMX3A6NHT5 357 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGAP5A6NIR3 686 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC38A8A6NNN8 435 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf100A8MU93 164 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D3LB9A6J9 549 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms