RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3R1P27986 724 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 APLP1P51693 650 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NAGLUP54802 743 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SFT2D3Q587I9 215 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SCD5Q86SK9 330 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 KBTBD6Q86V97 674 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 STON2Q8WXE9 905 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO7AQ13402 2215 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINB5P36952 375 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 AVPR1AP37288 418 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GLRBP48167 497 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAA1Q13131 559 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 UGP2Q16851 508 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MIB1Q86YT6 1006 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR78Q96P69 363 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 VCX3BQ9H321 246 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRDP23468 1912 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RGSL1A5PLK6 1076 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA9O76027 345 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP11A1P05108 521 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ARNTP27540 789 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 EPHA3P29320 983 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 POLD2P49005 469 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 DSC1Q08554 894 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 POU6F1Q14863 301 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ARTNQ5T4W7 220 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 BEND5Q7L4P6 421 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TMC7Q7Z402 723 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 LSMEM2Q8N112 164 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PXYLP1Q8TE99 480 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF208Q9H0X6 261 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 GLOD4Q9HC38 313 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT9Q9Y305 439 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MAFKO60675 156 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 FKTNO75072 461 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 VAPBO95292 243 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SELPP16109 830 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SCYL1Q96KG9 808 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BNX3 289 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NEMP1O14524 444 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A2O15244 555 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRBP14927 111 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXC13P31276 330 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ADRA1AP35348 466 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MPP1Q00013 466 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CTBP1Q13363 440 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 LPCAT4Q643R3 524 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP97Q8IW35 865 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC16Q8NEE8 873 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 IPMKQ8NFU5 416 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 HAPLN3Q96S86 360 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 EYSQ5T1H1 3165 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 DLX3O60479 287 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB10P61026 200 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RTP2Q5QGT7 225 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX32Q86XE0 403 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 HIPK4Q8NE63 616 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 GIPC2Q8TF65 315 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NUF2Q9BZD4 464 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PATJQ8NI35 1801 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MATN3O15232 486 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 IRAK2O43187 625 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CPB1P15086 417 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC11A1P49279 550 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC36Q1X8D7 754 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms