RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 TPD52L3Q96J77 140 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NUAK2Q9H093 628 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LHX5Q9H2C1 402 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PDK4Q16654 411 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 STRADAQ7RTN6 431 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PSMG1O95456 288 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MGAT1P26572 445 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACADLP28330 430 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 UGT1A5P35504 534 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MIEF2Q96C03 454 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 OMDQ99983 421 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GRIN2DO15399 1336 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HDAC3O15379 428 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RPTNQ6XPR3 784 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMC8Q8IU68 726 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MPP5Q8N3R9 675 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BHMTQ93088 406 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DUSP16Q9BY84 665 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 E5RJQ4 531 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LIASO43766 372 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IFNGP01579 166 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PFKFB4Q16877 469 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HYIQ5T013 277 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PHF21BQ96EK2 531 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCR4P51679 360 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IRF8Q02556 426 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 IRGQQ8WZA9 623 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJC18Q9H819 358 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SHPRHQ149N8 1683 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ATP9AO75110 1047 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PRKAR1AP10644 381 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 GABRB2P47870 512 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC80Q76M96 950 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SHC3Q92529 594 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ELMO1Q92556 727 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CAPN10Q9HC96 672 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CYP3A5P20815 502 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CD86P42081 329 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 CRATP43155 626 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 C21orf59P57076 290 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SMYD1Q8NB12 490 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 HAVCR1Q96D42 359 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 ITCHQ96J02 903 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 WDR18Q9BV38 432 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-201ENST00000356100 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.06□□□□□ -1.44
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