RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 TMEM233B4DJY2 109 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 M0QYV0 167 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NAGLUP54802 743 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TTLL4Q14679 1199 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 DGKDQ16760 1214 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SLC36A3Q495N2 470 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CPNE1Q99829 537 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NACA2Q9H009 215 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CXCL11O14625 94 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CLOCKO15516 846 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TPST1O60507 370 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 INAQ16352 499 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GRTP1Q5TC63 336 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 LAYNQ6UX15 382 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CLEC14AQ86T13 490 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 CERS2Q96G23 380 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 RBBP8Q99708 897 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 SEPT3Q9UH03 358 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 AURKCQ9UQB9 309 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GINS2Q9Y248 185 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MED7O43513 233 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 MICAL2O94851 1124 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 OPRL1P41146 370 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ARMCX2Q7L311 632 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HOMEZQ8IX15 550 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 ISL2Q96A47 359 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 RNF19AQ9NV58 838 aa16.96■□□□□ 0.31
GDE1-201ENST00000353258 TRIP11Q15643 1979 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 C2P06681 752 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V1B2P21281 511 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 REP15Q6BDI9 236 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 DHFR2Q86XF0 187 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 A8MU76 341 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 LGALS2P05162 132 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 ARSAP15289 507 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 LIMK2P53671 638 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 LRP8Q14114 963 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 LIPMQ5VYY2 423 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 AFG1LQ8WV93 481 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 BCO2Q9BYV7 579 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 EHD1Q9H4M9 534 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 IL18RAPO95256 599 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB17Q13105 803 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 PPIL2Q13356 520 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 BFSP2Q13515 415 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SNX31Q8N9S9 440 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 OR2T3Q8NH03 318 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SEPT8Q92599 483 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 AGAP2Q99490 1192 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 PSD2Q9BQI7 771 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 CD300AQ9UGN4 299 aa16.95■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 SBF1O95248 1867 aa16.94■□□□□ 0.3
GDE1-201ENST00000353258 MLNP12872 115 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms