RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 PRAMEF10O60809 474 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BAP1Q92560 729 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RAB23Q9ULC3 237 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AIREO43918 545 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MYL3P08590 195 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MED22Q15528 200 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCNA10Q16322 511 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MTMR8Q96EF0 704 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.29□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CENPBD1B2RD01 187 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 EML1O00423 815 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PIGNO95427 931 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MNDAP41218 407 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 OR2B6P58173 313 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PIF1Q9H611 641 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PET100P0DJ07 73 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RORCP51449 518 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AP1S1P61966 158 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ECT2LQ008S8 904 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DAW1Q8N136 415 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM13CQ8NE31 585 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM159Q96B96 161 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 AP1S3Q96PC3 154 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KIF1AQ12756 1690 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PSMD11O00231 422 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 UGT2B17O75795 530 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CLCN5P51795 746 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MED8Q96G25 268 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MBOAT7Q96N66 472 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZW10O43264 779 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CSPG5O95196 566 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KCNA6P17658 529 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC6A2P23975 617 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HALP42357 657 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SLC5A3P53794 718 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GNG2P59768 71 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BBS4Q96RK4 519 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PSME2Q9UL46 239 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TRIP11Q15643 1979 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 KLHL33A6NCF5 533 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NTRK1P04629 796 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 EPB42P16452 691 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BNIP1Q12981 228 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 HYIQ5T013 277 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 XPR1Q9UBH6 696 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 FETUBQ9UGM5 382 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 POLIQ9UNA4 740 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 TTC3P53804 2025 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 NODALQ96S42 347 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DISP1Q96F81 1524 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 DGKAP23743 735 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 RP1P56715 2156 aa8.28□□□□□ -1.08
PKHD1-201ENST00000340994 BMPR2Q13873 1038 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms