RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DBX2Q6ZNG2 339 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCNT7Q6ZNI0 430 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRLQ86TD4 932 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATPAF2Q8N5M1 289 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH19Q8TAB3 1148 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAF2Q96CS3 445 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSKH2Q96QS6 385 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRK1Q38SD2 2015 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLRT2O43155 660 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA12O60330 932 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBFA2T3O75081 653 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMP2P16035 220 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKT2P31751 481 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP25P42331 645 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 OVGP1Q12889 678 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRM3Q14832 879 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSWIM9Q86XI8 627 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD6Q8NC69 237 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEM1CQ96JP0 617 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSMCE3Q96MG7 304 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT3Q9UH03 358 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD3Q9Y2F9 522 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEMP1O14524 444 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD51BO15315 384 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 DFNA5O60443 496 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITIH2P19823 946 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 FECHP22830 423 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN2P57739 230 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC7BQ86TV6 843 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMK1DQ8IU85 385 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PQLC3Q8N755 202 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCAR2Q8TDS4 363 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF5Q92565 580 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PANX2Q96RD6 677 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUV39H2Q9H5I1 410 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP295Q9C0D2 2601 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLON5A6NGN9 336 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEC1O60732 1142 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 THEGLP0DJG4 465 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA1P43355 309 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT2Q10471 571 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF235Q14590 738 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP7D3Q8IWC1 876 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC170Q8IYT3 715 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGBD5Q8N414 524 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13H1Q8NG92 308 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD8Q9HCK8 2581 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPRP12270 2363 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K6O95382 1288 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 CR2P20023 1033 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDELR1P24390 212 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA4P29622 427 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RENBPP51606 427 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUOXP51687 545 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1S1P61966 158 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGP2Q16851 508 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRAT1Q6PJG6 821 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATAD2AQ86YP4 633 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXR1Q8N573 874 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB12Q8WXK4 309 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECHDC3Q96DC8 303 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGME1Q9BQP7 344 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR27Q9NS67 375 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFR2Q9UP52 801 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 HYOU1Q9Y4L1 999 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACACBO00763 2458 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRD1A4D1F6 860 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NNZ2 444 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 YKT6O15498 198 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP20O60882 483 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPAP23025 273 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms