RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 ANKRD36A6QL64 1941 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 TIMM44O43615 452 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 SIN3BO75182 1162 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 TMCC1O94876 653 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 GPM6BQ13491 265 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 SLC5A9Q2M3M2 681 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 FSTL4Q6MZW2 842 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 DCLK2Q8N568 766 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 ISL2Q96A47 359 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 EXOC2Q96KP1 924 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 NUDCD1Q96RS6 583 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 VPS51Q9UID3 782 aa28.23■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 NDST3O95803 873 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 ERVK-21P61565 698 aa28.22■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 FYB2Q5VWT5 728 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 RNF43Q68DV7 783 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 TPGS1Q6ZTW0 290 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 NLRP9Q7RTR0 991 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 ATP2A3Q93084 1043 aa28.22■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 PER2O15055 1255 aa28.22■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28.22■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 DPP7Q9UHL4 492 aa28.22■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 PRSS36Q5K4E3 855 aa28.21■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 FIBINQ8TAL6 211 aa28.21■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa28.21■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 VPS39Q96JC1 886 aa28.21■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 PLK2Q9NYY3 685 aa28.21■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 SERPINB8P50452 374 aa28.2■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 NTHL1P78549 312 aa28.2■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 LAMB3Q13751 1172 aa28.2■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 APCDD1Q8J025 514 aa28.2■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 SPOCK2Q92563 424 aa28.2■■■□□ 2.11
CCZ1-201ENST00000325974 PTPRN2Q92932 1015 aa28.2■■■□□ 2.11
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CCZ1-201ENST00000325974 MYOFQ9NZM1 2061 aa28.2■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 LDB2O43679 373 aa28.2■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 SNX3O60493 162 aa28.2■■■□□ 2.1
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CCZ1-201ENST00000325974 PITPNM3Q9BZ71 974 aa28.2■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
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CCZ1-201ENST00000325974 ACDQ96AP0 544 aa28.18■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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CCZ1-201ENST00000325974 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.18■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 AHSGP02765 367 aa28.18■■■□□ 2.1
CCZ1-201ENST00000325974 GABRB3P28472 473 aa28.18■■■□□ 2.1
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